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La calidad microbiológica del agua enfriada y procesada en unidades odontológicas ha de ser asegurada para prevenir riesgos de infecciones en pacientes inmunodeprimidos. El calentamiento del agua en unidades odontológicas así como el largo periodo de estancamiento en su enfriamiento (noches y fines de semana) pueden provocar la colonización y proliferación de bacterias. En aquellos tratamientos donde se utilice agua enfriada existe un riesgo en la inhalación de aerosoles dañinos para pacientes y personal médico.
De conformidad con normas internacionales, el Instituto Robert Koch (RKI) recomienda un conteo de legionela menor o igual a 1 CFU/ml. en el agua enfriada procedente de unidades odontológicas. Según las directrices de (RKI), los pacientes inmunodeprimidos sólo podrán ser expuestos a agua libre de pseudomonas, cryptosporidia, y legionela. Sin embargo la rehabilitación sostenible de unidades contaminadas mediante desinfección térmica o química es extremadamente difícil debido a la presencia de biofilm adherido a las paredes de los conductos de la unidad, además el impacto de desinfectantes químicos sobre el paciente y la unidad habrán de ser tenidos en cuenta. Los filtros de membrana tendrán que ser usados para proporcionar una barrera segura contra bacterias manteniendo así la calidad microbiológica requerida en el agua.
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